在第三舰队被彻底消灭过后，开菊兽继续回到了岸边，并且继续对旧金山市进行袭击。
好在趁着这一段时间，不少的居民已经被紧急撤离，同时大量的军队也被调集了过来。
只是在尝试了常规武器没有效果，并且开菊兽还在不断地扩大攻击范围之后，美国最终还是和原剧情一样，选择使用核弹将它杀死。
在开菊兽死亡之后，美国第一时间行动起来，把斧首死亡的地方封闭取来，并且针对开菊兽的残骸进行研究。
这个时候，改头换面的林克也作为参与研究的科学团队的一员，来到了被封闭的区域，并且对开菊兽残余的尸体进行了有针对性的研究。
根据电影中的一些提示，林克的研究很有方向性，很快就提交了一大批的研究成果，其中包括开菊兽血液的作用，还有利用开菊兽血液可以制作的信息追踪雷达。
紧接着还有对于开菊兽来历的研究，在终结者还有林克的引导下，最终发现了海底深处的虫洞，做出来了对方是外星入侵者的假设。
最终，这些研究成果被公开给了世界上每一个国家，并且开始筹划建立一个国际性的组织来解决开菊兽的问题。
这个时候，林克通过整理出来的专业资料，向世界各国提出了‘猎人计划’，提议建造巨大的机甲来和开菊兽对抗。
巨大的机甲，可以把开菊兽有效的阻挡在大陆架当中，并且凭借强大的动力，使用铁拳来把开菊兽打成内伤，然后在尽量不流血，不造成污染的前提下杀死它们！
在林克和他手下大量终结者造势和带动之下，整个世界都开始忙碌了起来。
“……现在我荣幸和庄严的宣布！为了对抗开菊兽的威胁！人类将团结一致！环太平洋联合军防部队（PPDC）就是我们人类的利剑！而现在，这把即将刺向开菊兽胸膛的武器，正式出鞘！”
2013年9月15日，联合国召开峰会，‘环太平洋联合军防部队’正式成立，在发表了一番振奋人心的演讲之后，由世界各国派遣代表，组成了PPDC的初步框架。
在峰会上，首次确认了这种怪兽的名称为开菊兽，并且把入侵美国旧金山的那只开菊兽命名为斧首。
建造巨型机甲来对抗开菊兽的猎人计划正式提交PPDC进行讨论，并且获得了最大的支持。
2013年12月，在美国阿拉斯加州的科迪亚克岛上，PPDC的第一个猎人基地就建立在这里。
林克以首席科学家的身份加入基地，和他一起的还有佩吉，她主要是负责研究开菊兽，同时林克还招揽了精通机械制造的科学家加斯帕·谢菲尔德和脑神经科学家凯瑟琳·莱特卡普。
四个人开始了合作，佩吉最擅长的就是生物改造方面的研究，加斯帕擅长猎人机甲的研发，凯瑟琳则负责开发人脑和机甲连接的相关技术，林克则给他们提供支持和建议，完善他们的研究。
在林克的指引之下，他们的研究进度都非常不错，利用开菊兽残骸发现了一种特殊的晶体结构，该物质与地球上所有已知元素不同，被命名为开菊结晶。
当利用将开菊结晶融入金属当中之后，合金的韧性和强度都得到了极大地加强，这也是机甲猎人得意建造出来的关键。
另外林克利用天界模拟仓的相关技术，成功的构建了人脑与机甲连接的系统。
按照剧情，连接系统开发出来之后，因为一个人的大脑无法承担这么复杂的计算量，所以不得不研发由双人共同连接操作的方式来操纵机甲。
不过这个方案被林克直接否决了，他拿出来了超级人工智能‘星河’。
作为超级人工智能，‘星河’拥有极其强大的计算能力，可以辅助人脑完成超过百分之九十的复杂计算，如此一来，就极大地缓解了人脑的压力，让单人操纵机甲得以实现。
2014年2月，就在首个机甲猎人开始建造的时候，新的开菊兽‘巨爪’在菲律宾马尼**陆，早有准备的军队很快将开菊兽引诱到无人区，然后两枚核弹炸死。
一个月之后，猎人机甲初次试验开始进行，这个实验型机甲尽管还有很多的缺陷，只能够勉强做到行动，许多动作都无法做出来，不用实验，就知道完全无法对抗开菊兽。
但这一台实验性机甲也成功的实现了从无到有的突破，任何一个作为科研的人都知道，从零突破到1是最难得一部分，这一部分解决了，接下来的研究顿时进入了快车道。
2014年6月，开菊兽‘梭角’袭击了墨西哥的圣卢卡斯角，这只开菊兽身体结构非常牢固，被核弹杀死之后甚至留下了全尸。它的尸体被美国用航母运送到了阿拉斯加州科迪亚克岛的猎人基地当中用于研究。
借助了这一只开菊兽的尸体，林克针对开菊兽的研究也加快了许多，其中关键是开菊兽的大脑信息读取实验。
用科技的方法，除非像原剧情那样危险的方式，否则没有其他的办法。
林克自然不会冒险，因此他选择了使用神念摄取，只是最终只得到一些简单并且零散的信息。
作为生物兵器，开菊兽被制造出来之后，就得到了进入虫洞到达地球然后尽全力破坏的命令，它的大脑中关于外星人的信息近乎于无。
不过通过记忆的画面，林克还是推断出来了一些东西，其中主要是虫洞那边开菊兽被培养出来的环境，整个风格和地球迥异，不过在林克看来，更像是一个大型生物实验室，而不是兵工厂。
“不过这也正常，毕竟只是一个兵器，是不需要什么思想的。”林克心中想着：
“看来想要通过开菊兽更多的知道虫洞那边的信息是不太可能了，不过开菊兽本身代表的生物科技却有极大的价值。”
开菊兽本身代表的生物技术是很不错的，佩吉就从其中延伸出来了数种生物技术，可以重新激活人体细胞，延长寿命。
如今佩吉正在着手开发超级强化药剂，主要是加强人体体质，突破人体极限，有一些类似于美国队长的超级血清。
除此之外，还有超能血清的开发进度也得到了加快，这方面技术主要来源于绯弹世界的弗拉德。
他利用自己特殊的体质，融合了多种超能力，不过其中弗拉德本身的吸血鬼体质起到了最关键的作用。
在弗拉德被林克捕获之后，他就成了实验品，佩吉一直都想要研发出来可以让普通人都觉醒超能力的血清，不过到现在为止，并没有什么特别的成果。
不过在研究了开菊兽之后，佩吉也延伸出来了几个方法，正准备进行实验。