白世界——
小智在结束了又一段充满挑战与冒险的旅程后，满载着回忆与收获，回到了他熟悉而温馨的真新镇。
回来没多久，就听到了小茂要离开真新镇的消息。
从大木博士那得知小茂只带走水箭龟，而其他的宝可梦则都留在了研究所后院。
出于对好友的关心和不舍，小智赶忙过去送行。
小茂表示想要知道多一些关于宝可梦的事情，所以才这么迫不及待地要离开真新镇。
为了表达自己对小茂的支持和祝福，小智从口袋里掏出了一个特别的礼物——半个精灵球，送给了小茂。
小茂离开后，小智跟皮卡丘坐在树枝上，意外地看到了凤王飞过。
......
【希巴：来了吗？小智要跟凤王对战了？】
【奇巴纳：真的又遇到了凤王了！】
.......
众人都在期待小智跟凤王的战斗，但小智没有像众人所设想的那样，热血沸腾地与凤王展开激战，而是静静地站起身，目光深邃地注视着凤王逐渐远去的背影。
凤王那优雅而庄严的飞翔姿态，如同在天空中勾勒出一幅壮丽的画卷。小智从凤王离去的轨迹中，那是前往丰缘地区的方向。
这个发现让小智的心中涌起了一股莫名的激动，他对丰缘地区充满了无尽的好奇与向往。
而小智也在这个时候想起了叶越，他是从丰源地区过来的，正好自己可以到丰缘地区旅行。
现在小茂都找到了自己的目标继续旅行，他现在也有了下一个继续旅行的目标。
晚上，小智便向大木博士等人说了自己的目标，要去丰缘这个地区旅行。
花子也知道小智的性子，也理解他对宝可梦的热爱。她默默地为小智收拾好了行李，甚至连前往丰缘的船票都为他准备好了。
大木博士也将丰缘地区的宝可梦图鉴交给了小智。
路上，小智带皮卡丘坐前往丰缘地区的游轮，而火箭队三人组也跟到了游轮上，趁小智不注意的时候抓走了皮卡丘，只是路上出了点意外，喵喵意外地和皮卡丘来到了一座城镇里的仓库。
皮卡丘跟喵喵遇到了一群宝可梦，它们被一群鬼斯通给欺负，霸占了它们的领地，皮卡丘赶跑了鬼斯通，那些宝可梦们就想皮卡丘留下来当它们的老大。
但这个时候火箭队的武藏跟小次郎抓走皮卡丘，那些小拉达、比雕出手救下了皮卡丘，被赶走的鬼斯通也过来帮助皮卡丘，经过皮卡丘的调解和火箭队三人组的“助攻”，小拉达们和鬼斯通们终于和好。
经过比雕的帮助，小智赶上了船，终于是来到了丰缘地区。
.......
【科拿：火箭队三人组可真坚持，从关东地区开始，跟了小智到橘子群岛、城都地区，现在又跟小智到另一个地区，他们跟踪小智比小智三人一起旅行的时间还要长！】
【小智：这个是真的，我现在到卡洛斯地区旅行，火箭队三人组也跟了过来，跟狗皮膏药一样甩都甩不掉，还一直对我的皮卡丘念念不忘。】
【小次郎：不止呢，在没有抓到皮卡丘时，我们都会一直跟着你的，毕竟都跟了你几个地区了，要是就这么放弃了，那我们之前的努力不就白费了吗？那我们之前受的苦，经常被皮卡丘电算什么？】
【小智：算...你们罪有应得！】
【小遥：哈哈哈，小智说得对！】
【武藏：臭小鬼头...你就现在开心开心吧，别给我们找到机会抓走皮卡丘。】
对于火箭队三人组的威胁，现在不止是小智一行人不放在心上，就连观影的众人都不把他们放在眼里。
虽说他们三个家伙是火箭队的，而且喵喵还很奇特会说话，但战斗力太低，完全不是小智一行人的对手。
初次见面的时候，以为火箭队三人组很厉害，到了后面，他们不再仅仅是单纯的反派，而是更多地以一种搞笑艺人的身份出现，经常在关键时刻“助攻”小智一行人，帮助他们解决难题或逃脱困境。
【小智：旅行的时候都要时刻注意火箭队，稍不留神就会被火箭队给抓走皮卡丘，还挺烦的。】
【小次郎：你把皮卡丘给我们，就再也不用怕烦了，这样对你我都好，一举两得！】
【武藏：就是就是！！！】
【小智：我是木讷，不是傻子！】
嘿嘿，答不答应，我们都是要抓走皮卡丘的.......
火箭队三人组互相对视一眼，心中的目标一致，从未改变过。
......
白世界——
皮卡丘受到了火箭队三人组用电磁吸收电力的方式，身体状态变得很虚弱，还发烧了。
小智就带皮卡丘寻求治疗，但镇上没有宝可梦中心，只好联系了小田卷博士。
但皮卡丘身上的电力太强，体内残余的电力竟然与研究所内的设备发生了剧烈的反应，直接导致了一场小规模的爆炸。受到惊吓的皮卡丘趁机逃出了研究所，它的体力已经达到了极限，电力在体内肆虐，几乎要失控。
皮卡丘踉跄着来到了一个悬崖边。身体的痛苦和精神的折磨让它几乎失去了理智，想要跳下悬崖，但小智毫不犹豫地跟着跳了下去，一只手抱住皮卡丘，另一只手紧紧抓住了悬崖边的树枝，用尽全力稳住了身形。
可真强......众人看到小智为了保护皮卡丘，不惜冒着生命危险跳下悬崖，心中充满了敬佩和震撼。他们都不知道有没有跳下去救宝可梦这个勇气，跟小智没法比，小智经常奋不顾身地保护宝可梦，他们看得也是很激动。
替皮卡丘高兴，找到了这么好的训练家！
小田卷博士跟小遥过来帮助小智，将他们拉了上来。
这个时候，火箭队三人组又来‘助攻’，用了电池机器人及时吸收皮卡丘电力。
皮卡丘身上的电力将火箭队的电池机器人给塞满，直接炸开。皮卡丘多余的电力被吸走而脱离了危险是好事，但小遥的自行车也因此被皮卡丘的电击给毁坏。
......
【小刚：又是小智，又是皮卡丘，又是火箭队...又贡献了一辆自行车！】
【马志士：历史总是惊人地相似......常磐市的宝可梦中心那也毁了一辆自行车，现在到新地区旅行，居然又毁了一辆自行车，皮卡丘都可以说是自行车杀手！】
【小智：那都是意外啦！】
“额，都是一样因为皮卡丘将自行车毁了才认识小智的。”
看到白光幕里边，自己跟小智第一次见面的场地，自行车就遭此大劫......小遥有些庆幸，要是自行车不坏，说不定她会错过小智呢。
现在小智不在身边没关系，通过这个光幕播放出来，那么小智应该会明白自己心意了吧。
......
回到了研究所，小遥选择了自己的初始宝可梦火稚鸡。
自己的自行车因为意外被毁坏，所以跟小智一起同行到古玫镇的宝可梦中心办理丰缘地区旅行的登记。