太医院：
主官
- 院使：一人，正五品，负责考察院属各科医务官员的业务才能，并率御医、吏目、医士等为帝后、王公大臣等治疗疾病。
- 院判：二人，正六品，佐院使掌院务。
属官
- 御医：最初四人，后增至十八人，隆庆五年最终确定为十人，正八品，各精一科，专为皇帝、后妃等治疗疾病。
- 吏目：一人，从九品，隆庆五年定设十人。
其他机构
- 生药库：设大使、副大使各一人，未入流，负责掌管药物。
- 惠民药局：设大使、副使各一人，未入流，主要为贫苦百姓提供医疗服务。
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洪武朝翰林院，洪武十八年（1385年）更定后：
主官
- 翰林学士：一人，正五品。
学士类
- 侍读学士、侍讲学士：各二人，从五品。
讲读类
- 侍读、侍讲：各二人，正六品。
其他文职类
- 五经博士：九人，正八品，且职位世袭。
- 典籍：二人，从八品。
- 侍书：二人，正九品。
- 待诏：六人，从九品。
- 孔目：一人，未入流。
史官类
- 修撰：三人，从六品。
- 编修：四人，正七品。
- 检讨：四人，从七品。
储备人才类
- 庶吉士：员额不定，无品级。
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国子监：
主官
- 祭酒：一人，从四品，掌国学诸生训导之政令等。
- 司业：一人，正六品，协助祭酒总理太学政事等。
绳愆厅
- 监丞：一人，正八品，负责监督并执行监规，纠正师生过失。
博士厅
- 五经博士：五人，从八品，分别讲授《易》《诗》《书》《春秋》《礼记》，同时兼习《大学》《中庸》《论语》《孟子》，并负责按时考核学生的学习进度。
六堂
- 助教：每堂十五人，从八品，负责各堂的教学与训导。
- 学正：每堂十人，正九品，掌执行学规，考校训导。
- 学录：每堂七人，从九品。
典簿厅
- 典簿：一人，从八品，负责管理文书、财务等事务。
- 典籍：一人，从九品。
掌馔厅
- 掌馔：二人，未入流，负责饮食安排。
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五军都督府:指中军，左军，右军，前军，后军。
都督府主官
- 左、右都督：正一品。
- 都督同知：从一品。
- 都督佥事：正二品。
经历司
- 经历：从五品。
- 都事：从七品。
断事司
- 洪武十七年，五军各设左、右断事二人，提控案牍一人，均为从九品。
- 洪武二十三年，升五军断事官为正五品，总治五军刑狱，分为五司，司设稽仁、稽义、稽礼、稽智、稽信五人，俱正七品，各理其军之刑狱。
照磨所
洪武二十九年，置五军照磨所，设照磨等官职，专掌文牍，但具体品级不详。
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卫指挥使司：
卫指挥使司主官
- 指挥使：正三品，是卫所的最高长官，全面负责卫所的军事、行政等事务。
- 指挥同知：从三品，通常设二人，协助指挥使处理卫所事务。
- 指挥佥事：正四品，协助指挥使和指挥同知管理卫所各项工作。
镇抚司
- 卫镇抚：从五品，负责卫所的司法、治安等事务，维持卫所内部的秩序。
经历司
- 经历：从七品，负责处理卫指挥使司的文书、档案等事务，是卫所内部重要的文职官员。
- 知事：正八品，协助经历处理日常事务。
- 吏目：从九品，负责具体的文书工作和一些杂务。
其他属官
包括仓大使、副使等，负责卫所的仓储、后勤等事务，品级通常较低，未入流或从九品以下。
亲军卫指挥使司指的是：“锦衣卫指挥使司，金吾左卫、金吾右卫、羽林前卫。”
地方卫指挥使司指的是：“北平都司、陕西都司、山西都司、山东都司、浙江都司、江西都司、四川都司、福建都司、湖广都司、广东都司、广西都司、辽东都司、河南都司。
陕西行都司、山西行都司、福建行都司、四川行都司、湖广行都司。”
特殊卫指挥使司：“中都留守司（专门守护黄陵）”
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千户所：
千户所主官
- 正千户：正五品，是千户所的主要长官，负责千户所的全面事务，包括军事训练、行政管理、后勤保障等。
- 副千户：从五品，协助正千户处理千户所事务，在正千户不在或其他特殊情况下，可代行正千户的职责。
镇抚
- 所镇抚：从六品，负责千户所的司法、治安等事务，维持千户所内部的秩序，处理士兵之间的纠纷和违纪行为等。
吏目
负责千户所内的文书档案管理、日常事务记录等具体事务性工作，未入流或从九品以下。
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地方官职:
三司
—承宣布政司:
左右布政使，从二品
左右参政，从三品
左右参议，从四品
提刑按察使司:
按察使，正三品
副按察使，正四品
佥事，正五品
都指挥使司:
都指挥使，正二品
都指挥同知，从二品
都指挥佥事，正三品
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府:
主官
- 知府：正四品，掌一府之政令，总领各属县，负责宣布国家政令、治理百姓，审决讼案，稽察奸宄，考核属吏，征收赋税等一切政务。
属官
- 同知：无定员，正五品，分掌地方盐、粮、捕盗、江防、海疆、河工、水利以及清理军籍、抚绥民夷等事务。
- 通判：无定员，正六品，在知府下掌管粮运、家田、水利和诉讼等事项，对知府有监察的责任。
- 推官：一人，正七品，掌推勾狱讼之事。
- 知事：一人，正九品，出守列郡，称为权知某府事。
- 照磨：一人，从九品，掌管磨勘和审计工作。
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州：
文职
- 知州：一人，从五品。是各州的长官，全面掌管一州之事，包括民政、财政、司法、治安等各项事务。
- 判官：无定员，从七品。作为地方长官的僚属，辅助知州处理政事，可分管盐、粮、捕盗、水利等具体事务。
- 吏目：一人，从九品。主要负责掌管文书工作，如文件的收发、登记、存档等，同时也协助处理一些日常事务。
武职
- 正千户：正五品，千户所的主要武职人员，负责军事管理和作战指挥等。
- 副千户：从五品，协助正千户进行军事管理和作战等工作。
- 镇抚：从六品，负责维护地方治安和军事秩序等。
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县：
文职
- 知县：一人，正七品。全面负责县内的行政管理，包括司法审判、税收征收、户籍管理、治安维护、教育推行等诸多事务。是朝廷在地方的代表，拥有最高决策权。
- 县丞：正八品，是知县的主要副手。通常协助知县处理文书档案管理，如收发、登记和保管官府文件，同时也负责仓库事务，像监管官仓的粮食存储与出入库。在知县外出或不能履职时，可代行知县部分职权。
- 主簿：正九品，主要协助管理户籍和赋税征收。负责登记户口信息，统计人口变化情况，以及具体的赋税核算、催缴等事务，确保国家的财政收入和人口统计工作顺利进行。
- 典史：一人，未入流。是知县下面掌管缉捕、监狱的属官。在县丞、主簿等官员裁撤时，其职责可兼任其他事务。
教育系统
- 教谕：一人，正八品。负责县儒学的教学和管理工作，教授学生儒家经典和文化知识，同时也负责组织县内的科举考试等文化教育活动。
- 训导：二人，正九品或从九品。协助教谕进行教学和管理工作，主要负责指导学生的学习和品德修养等。
巡检司
- 巡检：从九品。主要为州县所属捕盗官，负责在县城以外的重要交通路口或者治安复杂地区巡逻、缉捕盗贼等，维护地方治安。
- 副巡检：从九品。协助巡检进行捕盗等工作，在一些较大或治安形势较为严峻的地区设置。
其他派驻机构
- 驿丞：从九品。负责管理驿站，保障公文传递和过往官员的接待等工作。不是所有的县都有驿站，有些县驿站又不止一个，驿站由兵部和地方共同管辖。
- 税课局大使：从九品。负责全县的税收征收和管理工作，确保国家税收的足额征收和按时上缴等。
- 河泊所官：正九品、从九品或不入流。负责管理县内的河流、湖泊等水域的渔业税收和相关事务等。
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衍圣公，秩正二品。
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宦官：
十二监
- 太监：各监设太监一员，正四品。如司礼监太监，在宦官系统中权势和地位较高。
- 少监：左、右少监各一员，从四品。是太监的副手，协助太监处理事务。
- 监丞：左、右监丞各一员，正五品。负责具体事务的执行和监督等工作。
- 典簿：典簿一员，正六品，主要掌管文书档案等事务。
- 长随、奉御：无定员，均从六品，多从事侍奉皇帝及其家族的具体事务。
四司
- 司正：每司设司正一人，正五品，是各司的主要负责人。
- 司副：左、右司副各一人，从五品，协助司正工作。
八局
- 大使：每局设大使一人，正五品，负责本局的全面工作。
- 副使：左、右副使各一人，从五品，辅助大使处理事务。
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后宫：
洪武五年
尚宫、尚仪、尚服、尚食、尚寝、尚功六局和宫正一司，品级皆为正六品。每局领四司，其属二十有四，而尚宫总行六局之事，官七十五人，女史十八人。
洪武十七年
最高级别的“尚”字女官，品秩升为正五品，“司”字女官之下又分别对应增加“掌”字女官，正七品，宫正司增设司正一职，正六品。
洪武二十八年九月
增设“二十四典”，为正七品，改“二十四掌”为正八品，以佐“二十四司”处理各司事务；宫正司增设“典正”，正七品；尚仪局增设“彤史”，正六品。此时，凡宫官一百八十七人，女史九十六人。
此外，洪武朝的后妃职位等级，除皇后外，较高等级的有皇贵妃、贵妃、贤妃、淑妃、庄妃、敬妃、惠妃、顺妃、康妃、宁妃等。妃子级别之下还有嫔，再往下有贵人、才人、选侍、淑女等。但这些后妃通常无明确品级。