废除新法的理论建立完毕，人马也初具规模，司马光便有点迫不及待想实施了。因为他的身体越来越孱弱，能在有生之年废除新法，这是他的夙愿。
新法那么多，要想毕其功于一役，是不现实的，只能分步进行。司马光和吕公着商量来商量去，觉得先从“保甲法”入手更为妥当。因为司马光等提出废新法后，知枢密院事章惇写了几千字驳斥他们的观点，在驳斥文里，章惇自己提到：“如‘保甲法’一日不罢，有一日害！若免役等法，不应该更改，以免心生后悔！”这表示，章惇也是不太认可“保甲法”的。
吕公着进位尚书左丞没几天，执政大臣一起议事时，司马光直接提出彻底废除“保甲法”。宰相蔡确表示不太同意，但他又认为，如果真要废除，也不是不可以，但应该保留冬天训练一个月。司马举大喜，立即见缝插针，答应蔡确要求，随后朝廷下诏，罢除“保甲法”，但保留冬月训练。
司马光亲自出马，向新法发起总攻，第一战，只能说取得小胜。司马光深感力量不足，阻力太大，迫在眉睫的任务还是要扩充保守派势力。
九月，侍御史刘挚进言：“谏官、御史缺员，应该尽快补充。”十月初，太皇太后突然拿出一份谏官、御史的任命名单，让执政大臣讨论。名单为：范纯仁任左谏议大夫，唐淑问任左司谏，朱光庭任左正言，苏辙任右司谏，范祖禹任右正言。
司谏、正言都是谏官，在宋朝，谏官、御史的位置非常重要。
太皇太后问执政大臣道：“这五人如何？”
章惇感觉非常突然，立即指出，这样的任命不符合制度，谏官都是执政大臣拟定进呈皇帝的，哪有从宫中直接拿出名单的道理，章惇既而提出疑问，莫非是陛下身边的宦官捣鼓的？
太皇太后连忙道：“这都是大臣推荐的，不是左右内侍提出的。”
章惇道：“大臣推荐应该光明正大的说出来，怎么偷偷摸摸？”
话说到这份上，吕公着和司马光只好站出来表态，吕公着称范祖禹是自己女婿，司马光说范纯仁是哥哥司马旦的亲家，两人应该避嫌。
章惇更加来了精神，道：“谏官的职责就是纠绳执政大臣的不法和失误，按惯例，执政大臣在谏官位置上的亲戚应该回避！”
司马光以退为进地道：“范祖禹、范纯仁作谏官众望所归，不能因为我们的缘故妨碍贤良之士进步，臣宁愿自己辞职回避！”
章惇见目的达到，也假意道：“你们肯定没有私心，只怕以后有奸臣执政，以此为例！所以范祖禹、范纯仁不能担任谏官。”
范祖禹改任天章阁待制，范纯仁任着作郎。其他三人任命照旧。这场谏官任命的交锋，看似新派章惇胜利，实际是保守派获得大胜，因为唐淑问、朱光廷、苏辙是保守派的中坚力量。而范祖禹、范纯仁不过是他们的烟雾弹而已。用来打掩护的，章惇、蔡确聪明一世，也被司马举摆了一道，当然，司马光的主张得到了太皇太后高氏的鼎力支持。
在言官位置上，保守派一下增加了三员主将，此后，他们攻击新派可以说是不遗余力。
司马光和吕公着以两范为掩护，“丢车保卒”，却是三个过河卒，端的异常凶猛，饶是章惇聪明过人，也上了恶当。
接着刘挚再出手，攻击皇帝侍讲陆佃、蔡卞资历太浅，应该选通经术、有品行、淳厚老成的人充任。于是赵彦若兼任侍讲，傅尧俞兼任侍读，这又是两位保守派。
另一位主攻手监察御史王岩叟，则将矛头直接对准章惇，王岩叟上言道：“听闻章惇在垂帘前质问陛下任命谏官事，慢上渎尊，语言轻侮，人神共愤，请将他罢黜！”
王岩叟的奏疏刚递上去，刘挚的奏疏又进来了，这次刘挚瞄准的是首相蔡确，刘挚找蔡确什么茬？他指责蔡确在神宗灵柩进发的路上，没有陪着灵柩入宿，态度不恭敬！
刚提拔上来的左正言朱光廷，跟着补刀，进言道：“蔡确受先帝提携，位至宰相，却在灵驾之前，先走数十里之远，为臣不恭，莫大于此！”还说章惇欺罔强辩，韩缜怀着邪心邀宠。而且连接上了几次奏疏，语气悲愤恳切。
三位谏官御史一套组合拳打过去以后，太皇太后虽然没有批准，却搞得蔡确、韩缜、章惇三人晕头转向。
而在这时，司马光又向太皇太后请求，罢除“方田均税法”，蔡确、章惇等人自己焦头烂额，哪有精神理会新法不新法？
十一月，朝廷下诏，罢“方田均税法”。保守派获得第二个阶段性胜利。
佐料：据《宋史.苏轼传》记载：
哲宗即位不久，司马光任职门下侍郎，章惇任职枢密使，一个保守派，一个新法派，两个人政见不合，关系不睦。章惇地位稍微高些。
更为严重的是，章惇口舌如簧，盛气凌人；而司马光谦谦君子，温良敦厚。加上身体多病，章惇因此常常戏弄侮辱司马光，司马光为此万分苦恼。
恰好苏轼也在不久调入朝廷，任职礼部郎中。苏轼和司马光、章惇的关系都很要好。作为中间人，苏轼劝说章惇道：“司马光深孚众望。三国许靖因有虚名却无实际才能，被刘备所鄙视，法正说：‘许靖天下知名，如果对他不给予高的礼遇，必然会被天下人认为我们轻慢贤人。’刘备采纳了法正的建议，委任许靖做了司徒的高官。刘备连许靖这样的人都不敢轻慢，何况本朝德高望重的司马光呢?”
章惇觉得苏轼说得有道理，不敢再戏弄侮辱司马光了，于是司马光得以安宁。
从这则典故可以看出，章惇和司马光除了私人关系不好之外，章惇是不把司马光放在眼里的。